#WarpHelix 技术架构与安全

10,000+ 篇生物医学论文
         ↓ Action Discovery（动作发现）
150+ 专业工具 + 59 个数据库 + 105 个软件包
         ↓ 统一接口封装
Biomni-E1 统一生物医学环境

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│                   用户层                       │
│  Web UI  ←→  WebSocket 实时通信                │
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│                 应用服务层                      │
│  用户管理 │ 配额计量 │ 对话管理 │ 文件管理       │
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│                AI Agent 层                    │
│  ┌─────────┐  ┌──────────┐  ┌───────────┐  │
│  │ LLM 推理 │  │ 工具发现   │  │ 代码执行   │  │
│  │ (Think)  │  │ (Search)  │  │ (Execute) │  │
│  └─────────┘  └──────────┘  └───────────┘  │
│           ↕ 检索增强规划 (RAP)                  │
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│            Biomni-E1 执行环境                   │
│  150+ 工具 │ 59 数据库 │ 105 软件包             │
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│               基础设施层                        │
│  LLM API │ 数据库 │ 文件存储 │ 沙箱环境          │
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用户提问："分析这组基因变异数据"
    │
    ├── 🧠 Think（思考）
    │   ├── 理解用户意图
    │   ├── 评估数据特征
    │   └── 规划分析路径（可能包含多个步骤）
    │
    ├── 🔍 Search（搜索工具）
    │   ├── 从 150+ 工具中检索相关工具
    │   ├── 评估工具适用性
    │   └── 确定工具调用顺序
    │
    ├── ⚡ Execute（执行）
    │   ├── 生成 Python/R/Bash 代码
    │   ├── 在安全沙箱中执行
    │   └── 捕获执行结果和日志
    │
    ├── 👁️ Observe（观察）
    │   ├── 检查执行结果是否正确
    │   ├── 发现问题 → 回到 Think 重新规划
    │   └── 结果满意 → 继续下一步
    │
    └── 📋 Solution（综合报告）
        ├── 整合多轮分析结果
        ├── 生成可视化图表
        └── 输出结构化报告

用户输入
    ↓ HTTPS 加密传输
WarpHelix 服务
    ├── 对话记录 → 加密数据库（仅该用户可见）
    ├── 上传文件 → 加密文件存储（用户隔离）
    ├── 分析代码 → 安全沙箱执行
    └── LLM 调用 → AWS Bedrock / DashScope API
                    （不存储、不训练）

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│           Docker Compose              │
│                                      │
│  ┌──────────┐  ┌──────────────────┐  │
│  │ Frontend  │  │ Backend (API)    │  │
│  │ (Nginx)   │  │ + Agent Engine   │  │
│  └──────────┘  └──────────────────┘  │
│  ┌──────────┐  ┌──────────────────┐  │
│  │ Database  │  │ File Storage     │  │
│  │ (MySQL)   │  │ (Local / S3)     │  │
│  └──────────┘  └──────────────────┘  │
│  ┌──────────────────────────────────┐│
│  │ Code Execution Sandbox           ││
│  └──────────────────────────────────┘│
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